仙客来主要的病害有灰霉病、炭疽病、细菌软腐病；虫害有根结线虫、孢囊线虫病等。
灰霉病发生在仙客来的叶片、叶柄及花上。病初起时，叶片上出现暗绿色内白色小斑，呈水浸状斑纹，以后逐渐蔓延到整个叶片，导致叶片干枯面死。叶柄和花梗受害后，会发生水浸状腐烂，并生在灰色霉斑。发病期，可用70%托布津1000-1500倍液或1%等量式波尔多液每半个月喷洒1次防治。
炭疽病多发生在仙客来叶的背面，初为褐色小斑，病斑呈纶纹状赂外扩展，近圆形或不规则状，后期病斑上会出现黑灰色粒状物。发现此病感染叶片后，应及时剪除病叶并加以销毁。也可用60%炭疽福美800-1000倍液，或用50%多菌灵可湿性粉剂500-600倍液，每周喷洒1次防治，一般2-3次可见效。
细菌性软腐病多发生在仙客来叶柄和球茎上，初期呈现水浸状软化，叶绿减退，出现白色或暗灰绿色病斑，扩展后病组织软腐、膨胀、破裂、表皮脱落，有臭味。球茎感染后，会变黑、软腐，呈糊状。防治方法是加强通风，注意排水、避雨。也可用200-1000ppm的链霉素或土霉素、青霉素液进行喷洒及涂抹病株。敌克松700倍液浇灌病根际土壤。
根结线虫病，由根结线虫寄生仙客来根部引起，线虫分泌物的刺激，使根组织肥大增生，形成许多瘤状物，从而破坏根部正常功能，导致生长减弱，甚至死亡。可用敌敌畏混剂原液熏蒸土壤，对土壤进行消毒处理，待2周后再播种或移栽。也可在盆中埋入15-50克的3%呋喃丹果粒进行防治。
孢囊线虫侵入幼苗根部后，形成许多大小不等的虫瘿，严重时细根变腐烂，叶片枯黄而死。可采用防治根结线虫的方法防治。