为防寒保暖，在冬季来临时，可先用废弃的泡沫塑料板，按照水培器皿外形尺寸的大小切割后，拼接粘合，将器皿包裹起来。当室温低于10℃时，可在水培花卉上覆盖旧报纸、塑料薄膜，或将水温提高到18℃-25℃，这样都会达到较好的防寒效果。如果家中养了热带鱼，还可在鱼缸顶部设置一块搁板，将水培花卉摆放其上，也可以使其安全越冬。
当冬季室温低于10℃时，大多数水培花卉已经处于休眠或者半休眠状态，此时应停止施用花卉水培营养液，只用自来水即可。同时，也要随时注意清洗植株的根系，保持器皿清洁。一般需要10天-15天换一次水，换水时可适当掺入一些温水，使水温保持在18℃-25℃左右为好。若水质清纯洁净，植株长势健壮，没有烂根，15天-20天乃至30天换一次水也不会影响其生长。对那些仍处于缓慢生长的水培花卉，如君子兰、马蹄莲等，可10天-15天施用一次营养液，以促其健康生长。
另外，在选择水培花卉时，还应尽量选择对温度适应范围较广的花卉，如龟背竹、合果芋、常春藤、雷神、虎眼万年青等品种进行水培，便于越冬管理。
冬季水培在北方屋内有暖气的可能条件会好点，南方的小伙伴们要想在冬季水培植物，可要选择好相应的植物，希望大家都能养出自己满意的花卉。